จุลินทรีย์ในลำไส้เป็นระบบนิเวศที่ทำจากแบคทีเรีย 100 ล้านล้านชนิดที่มีการพัฒนาขึ้นเพื่อให้อาศัยอยู่ในสภาวะพิเศษของลำไส้ ส่วนใหญ่ของแบคทีเรียเหล่านี้ไม่เป็นอันตรายต่อครอบครัวของพวกเขา แต่จะเป็นประโยชน์แทน จุลินทรีย์ที่มีสุขภาพดีเช่นเดียวกับป่าที่มีสุขภาพดีมีหลายชนิดที่มีอยู่ร่วมกันและสามารถป้องกันผู้บุกรุกที่ไม่เป็นมิตร

เช่นแบคทีเรียที่ก่อให้เกิดโรคหรือชนิดที่รุกราน ในมนุษย์และหนู phyla Firmicutes และ Bacteroidetes ประกอบด้วยส่วนใหญ่ของชุมชนจุลินทรีย์ในลำไส้ นักวิจัยพบว่าแบคทีเรียในไมโครบิโม่สามารถปรับระดับของโปรตีนที่มีส่วนช่วยในการเปลี่ยนวิตามินเอให้เป็นรูปแบบที่ใช้งานได้ในระบบทางเดินอาหารของเจ้าภาพในการมีส่วนร่วมในการควบคุมระบบภูมิคุ้มกันของเจ้าภาพ การแสดงออกของโปรตีนในเซลล์ที่มีลำไส้เล็ก โปรตีนเรตินอลไฮโดรจีเนส 7 จะแปลงโภชนาการวิตามินเอเป็นกรด retinoic ไวษณพกล่าว แบคทีเรีย Clostridia ร่วมกับทั้งหนูและผู้ชายยังสนับสนุนการจัดเก็บวิตามินเอเพิ่มขึ้นในตับอีกด้วย